医治消化体系的药物有抑酸药、胃黏膜维护药、加强胃动力药物、安排肠道菌群、安排肠道动力等药物。起初，若是患者映现消化体系疾病，紧要外示为胃部不适症状，这种境况能够针对全体的症状，服用抑酸药，如奥美拉唑、雷贝拉唑等，胃黏膜维护药，如铝碳酸镁品味片、果胶铋等，以及加强胃动力药物，如众潘立酮、莫沙必利等医治。其次，若是患者消化体系疾病紧要外示为肠道不适症状，能够服用安排肠道菌群的药物，如双歧杆菌四联活菌片等，以及安排肠道动力的药物，如马来酸曲美布汀等医治，改观症状。
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